More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1234 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 159 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4973  histone family protein DNA-binding protein  52.08 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00898585  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 232 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 98 aa  87.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  47.19 
 
 		 90 aa  87  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  48.39 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 94 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 92 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 94 aa  84  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  84  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  47.19 
 
 		 90 aa  84  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 209 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.94 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  44.94 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  44.94 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  44.94 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  44.94 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  44.94 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.94 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  44.94 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  45.83 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  45.83 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  43.82 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3538  HU family DNA-binding protein  47.78 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00490432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  40.62 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3392  HU family DNA-binding protein  46.67 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000680811  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  47.67 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  39.33 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.94 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  42.53 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  42.7 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  43.62 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  42.7 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  42.7 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3359  histone-like DNA-binding protein HU-beta (NS1)  44.44 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3555  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  42.7 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  42.7 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3231  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  41.38 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  42.55 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  40.45 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>