59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0781 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0781  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 711 aa  1363    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3644  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.62 
 
 		 1740 aa  79  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511908  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.33 
 
 		 1217 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  30.34 
 
 		 774 aa  58.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1764  hypothetical protein  35.5 
 
 		 985 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 		 960 aa  55.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 1334 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.42 
 
 		 608 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.85 
 
 		 636 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.26 
 
 		 1454 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.7 
 
 		 1364 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.67 
 
 		 464 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28 
 
 		 1399 aa  52  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.49 
 
 		 696 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.64 
 
 		 1188 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.31 
 
 		 1240 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1211 aa  51.2  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00230  U5 snRNP-specific 40 kDa protein, putative  32.46 
 
 		 374 aa  51.2  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.718611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  27.46 
 
 		 778 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.59 
 
 		 1766 aa  50.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1190 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.85 
 
 		 1557 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.76 
 
 		 742 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4560  WD-40 repeat protein  34.46 
 
 		 1116 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28 
 
 		 1523 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.23 
 
 		 1901 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.6 
 
 		 1357 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 		 578 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  26.28 
 
 		 1484 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  30.97 
 
 		 1209 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.71 
 
 		 1711 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.39 
 
 		 1807 aa  48.5  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  28.31 
 
 		 523 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.79 
 
 		 698 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.66 
 
 		 1363 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3194  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 428 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.04 
 
 		 943 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  32.24 
 
 		 954 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.64 
 
 		 1348 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  26.13 
 
 		 1208 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1643  WD-40 repeat protein  28.33 
 
 		 520 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.21 
 
 		 737 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  32.85 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 		 1760 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  24.72 
 
 		 443 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.43 
 
 		 1427 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.29 
 
 		 1831 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1670  WD-40 repeat protein  28.33 
 
 		 520 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  29.13 
 
 		 434 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 		 1236 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  22.57 
 
 		 1330 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  29.52 
 
 		 344 aa  44.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  29.1 
 
 		 826 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1152 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  33.72 
 
 		 565 aa  44.3  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.24 
 
 		 919 aa  43.9  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  29.5 
 
 		 1041 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25547  predicted protein  26.52 
 
 		 530 aa  43.9  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.967834 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  27.61 
 
 		 522 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>