35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0163 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  998    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  40.31 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  34.07 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  30.88 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  33.52 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  28.54 
 
 		 565 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  28.35 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  36.99 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6244  hypothetical protein  29.2 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.699378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  26.34 
 
 		 545 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  24.16 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  25.41 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  29.65 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  29.66 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  34.51 
 
 		 443 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  31.45 
 
 		 514 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  29.11 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  35.9 
 
 		 519 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  35.42 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  32.77 
 
 		 175 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  33.93 
 
 		 181 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  34.69 
 
 		 228 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  32.76 
 
 		 255 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  31.86 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4245  hypothetical protein  35.4 
 
 		 316 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  29.27 
 
 		 181 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  27.3 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  30.66 
 
 		 346 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0523  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  33.62 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  30.13 
 
 		 519 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  28.06 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  23.86 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>