More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1803 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  100 
 
 
261 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  35.55 
 
 
250 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  36.73 
 
 
266 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 
250 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  34.77 
 
 
250 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  36.05 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  33.98 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  33.98 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  33.98 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  33.98 
 
 
250 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  33.59 
 
 
250 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 
278 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 
278 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  32.92 
 
 
278 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 
266 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 
198 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1631  hypothetical protein  64.71 
 
 
87 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  29.72 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  28.27 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  29.51 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  29.96 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  26.15 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  28.34 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  27.27 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  27.96 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  27.23 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  27.36 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  27.36 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  27.36 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  27.36 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  27.23 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  27.36 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  41.24 
 
 
94 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  27.01 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  25.64 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  27.56 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.79 
 
 
339 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 
233 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  27.56 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  29.38 
 
 
327 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0540  beta-lactamase-like protein  26.96 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
249 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
329 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  29.17 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 
326 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  32.98 
 
 
136 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  32.77 
 
 
330 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
336 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  23.91 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 
344 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  28.32 
 
 
348 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>