291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1130 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  51.95 
 
 
974 aa  979    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  51.19 
 
 
970 aa  986    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  42.84 
 
 
1032 aa  763    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  41.99 
 
 
1024 aa  751    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  53.4 
 
 
983 aa  1030    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  38.33 
 
 
985 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  100 
 
 
970 aa  2018    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  53.39 
 
 
983 aa  1059    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  42.04 
 
 
1025 aa  758    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  51.9 
 
 
973 aa  1006    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  50.73 
 
 
967 aa  954    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  38.39 
 
 
987 aa  635  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  38.94 
 
 
972 aa  591  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  35.87 
 
 
1034 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.44 
 
 
964 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  33.58 
 
 
975 aa  477  1e-133  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  31.62 
 
 
970 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  32.7 
 
 
968 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.01 
 
 
976 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.95 
 
 
968 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  31.03 
 
 
979 aa  459  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  33.33 
 
 
968 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  30.42 
 
 
1046 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  33.48 
 
 
969 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  31.17 
 
 
969 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  28.84 
 
 
1017 aa  428  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  29.22 
 
 
992 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  31.74 
 
 
1049 aa  418  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  29.42 
 
 
987 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  28.45 
 
 
973 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  31.14 
 
 
968 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  30.01 
 
 
986 aa  408  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  28.88 
 
 
973 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  29.04 
 
 
1046 aa  389  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  27.51 
 
 
999 aa  324  5e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  24.87 
 
 
971 aa  322  3e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  27.7 
 
 
1010 aa  318  4e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  29.1 
 
 
972 aa  318  4e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  27.25 
 
 
949 aa  301  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  27.11 
 
 
985 aa  283  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  22.78 
 
 
1137 aa  214  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  23.32 
 
 
1054 aa  99.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  22.38 
 
 
1057 aa  94.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.76 
 
 
896 aa  84.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  28.71 
 
 
1049 aa  81.3  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  30.59 
 
 
937 aa  72.4  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.09 
 
 
945 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  24.86 
 
 
434 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  25.71 
 
 
949 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  25.71 
 
 
929 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  23.24 
 
 
465 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  23.24 
 
 
465 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  25.22 
 
 
415 aa  65.1  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  22.78 
 
 
949 aa  64.7  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  28.21 
 
 
959 aa  64.3  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  26.34 
 
 
439 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
443 aa  61.6  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  23.58 
 
 
504 aa  61.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  26.6 
 
 
451 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  23.94 
 
 
453 aa  60.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  25.51 
 
 
441 aa  61.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2248  peptidase M16 domain-containing protein  26.37 
 
 
647 aa  61.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.082562  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  28.16 
 
 
431 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  26.2 
 
 
459 aa  60.1  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  23.71 
 
 
461 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  26.32 
 
 
419 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  25.07 
 
 
443 aa  60.1  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  22.25 
 
 
930 aa  59.7  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  25.12 
 
 
455 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  26.86 
 
 
452 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  25.75 
 
 
493 aa  58.9  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  26.58 
 
 
431 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  24.54 
 
 
967 aa  58.9  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  27.12 
 
 
921 aa  58.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.08 
 
 
506 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  23.77 
 
 
947 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  24.78 
 
 
443 aa  58.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  24.85 
 
 
443 aa  58.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  24.17 
 
 
443 aa  58.5  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  23.87 
 
 
443 aa  58.2  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  24.92 
 
 
442 aa  58.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  25.12 
 
 
450 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  25.79 
 
 
868 aa  58.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  26.44 
 
 
878 aa  57.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  25.62 
 
 
450 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  27.72 
 
 
451 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  27.72 
 
 
484 aa  57.4  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  25.44 
 
 
501 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  23.56 
 
 
416 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  23.56 
 
 
416 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  23.56 
 
 
416 aa  57  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  24.51 
 
 
464 aa  57  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  24.48 
 
 
443 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  26.26 
 
 
937 aa  57  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 
454 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  23.75 
 
 
957 aa  56.2  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  23.64 
 
 
443 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  26.15 
 
 
454 aa  55.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  22.99 
 
 
428 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  23.61 
 
 
514 aa  55.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>