245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2617 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2617  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
218 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3812  phosphoheptose isomerase  53.24 
 
 
225 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0616302  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4583  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  50.94 
 
 
221 aa  158  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08080  phosphoheptose isomerase  46.05 
 
 
224 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3233  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  42.93 
 
 
223 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0862  phosphoheptose isomerase  37.91 
 
 
232 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296003  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0714  phosphoheptose isomerase  37.91 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  37.81 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0473  phosphoheptose isomerase  34.64 
 
 
199 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3209  phosphoheptose isomerase  36.84 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  37.37 
 
 
197 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  32.81 
 
 
197 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  38.3 
 
 
189 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  37.63 
 
 
208 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2549  Phosphoheptose isomerase-like protein  41.18 
 
 
391 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0968114  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  36.84 
 
 
189 aa  94.7  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  36.59 
 
 
187 aa  94  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08100  phosphoheptose isomerase  38.65 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  29.57 
 
 
196 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
189 aa  92  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  28.33 
 
 
186 aa  91.7  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  37.02 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  37.25 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  28.04 
 
 
195 aa  89  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
197 aa  89  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  35.95 
 
 
192 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  35.48 
 
 
280 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  35.85 
 
 
197 aa  88.2  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  30.23 
 
 
194 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
672 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  35.8 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  35.84 
 
 
188 aa  85.1  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  27.27 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3810  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  38.06 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  27.27 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  33.16 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4581  phosphoheptose isomerase  38.89 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  34.58 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  30.65 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  30.11 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  35.06 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  35.12 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  27.72 
 
 
191 aa  82  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  26.46 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  30.77 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2640  phosphoheptose isomerase  36.09 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  32.57 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  32.11 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  30.92 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  34.3 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  30.92 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  31.76 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  35.29 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  32.42 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  30.11 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  34.01 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  33.99 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  31.05 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 
189 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  27.42 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  33.55 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  33.79 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  31.18 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  31.18 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  35.86 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  26.2 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  31.18 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  28.65 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  31.18 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  31.18 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  31.18 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  27.42 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  31.64 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  34.59 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  35.22 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  28.57 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  36.87 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  30.73 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  31.96 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  29.14 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  29.61 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  30.23 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  33.16 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  34.9 
 
 
650 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  37.58 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  30 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  35.58 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>