More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0439 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  77.97 
 
 		 227 aa  345  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  64.12 
 
 		 273 aa  300  9e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  55.75 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2297  regulatory protein, MerR  55.75 
 
 		 245 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2421  MerR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  52.5 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  57.71 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  47.56 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  43.15 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  44.39 
 
 		 301 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1011  transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3253  transcriptional regulator, MerR family  32.57 
 
 		 249 aa  91.7  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000117096  decreased coverage  0.00000535061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1516  transcriptional regulator, MerR family  26.49 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  34.01 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  28.12 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0194  transcriptional regulator, MerR family  30.98 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  38.53 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 139 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 292 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 346 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 117 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 175 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 119 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  37.5 
 
 		 369 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 133 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  42.53 
 
 		 361 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 134 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 134 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  56.82 
 
 		 154 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  29.23 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 132 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  29.31 
 
 		 134 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  26.21 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 141 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 156 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  47.62 
 
 		 314 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2967  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000624507  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 157 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  31.62 
 
 		 132 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 133 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 134 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  36.08 
 
 		 355 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 176 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 163 aa  48.5  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 171 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  36.78 
 
 		 343 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  32.79 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 171 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 134 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  24.81 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  37.23 
 
 		 124 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  49.02 
 
 		 133 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>