171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0235 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  156  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  66.67 
 
 
68 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  66.67 
 
 
67 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  68.85 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  59.7 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  65.62 
 
 
68 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  55.07 
 
 
69 aa  77  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  55.38 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  59.7 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  52.24 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  55.71 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  58.67 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  54.69 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  54.05 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  51.43 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  53.12 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  56.45 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  52.24 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  53.73 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  57.81 
 
 
73 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  60.66 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  57.81 
 
 
73 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  56.25 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  50.77 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  59.02 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  51.72 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  58.46 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  55.17 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  57.58 
 
 
73 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  46.27 
 
 
77 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  61.82 
 
 
62 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  52.38 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  61.82 
 
 
62 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  48.44 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  58.49 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  48.75 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  51.72 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  47.69 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  58.33 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  46.27 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  56.45 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  49.23 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  46.27 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  48.44 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  61.82 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  61.82 
 
 
63 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  60 
 
 
63 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  53.57 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  53.57 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  49.25 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  56.67 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  61.82 
 
 
63 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  60 
 
 
63 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  54.69 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4271  protein of unknown function DUF397  53.33 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  46.97 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  55 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  49.18 
 
 
62 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  57.14 
 
 
62 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  46.97 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  58.18 
 
 
62 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  52.54 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  59.65 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
83 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  52.54 
 
 
62 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  47.06 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  54.1 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  58.18 
 
 
63 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  55.93 
 
 
64 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  49.23 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  46.97 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  48.44 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  52.73 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  47.69 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  45.31 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  55.36 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  47.69 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  51.47 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  52.24 
 
 
69 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  47.54 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  51.52 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  35.94 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  46.15 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  47.69 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  47.62 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  45.83 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  48.28 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  35.87 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  53.7 
 
 
64 aa  53.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>