More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1753 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  338  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  88.89 
 
 
171 aa  306  5.9999999999999995e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  64.5 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  59.06 
 
 
166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  55.76 
 
 
174 aa  202  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  39.77 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  38.04 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  38.73 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  41.74 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  42.97 
 
 
148 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  44.26 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  44.44 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  40.88 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  35.94 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  41.38 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  41.51 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1191  hypothetical protein  42.61 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  35.66 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  39.2 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  46.43 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  39.2 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  48.04 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  31.98 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  31.98 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.42 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  35.16 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  33.33 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  33.09 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  36.63 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  27.85 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  35.04 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0153  hypothetical protein  38.66 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  35.07 
 
 
275 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.73 
 
 
267 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  30 
 
 
240 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  33.64 
 
 
154 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.92 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  32.82 
 
 
161 aa  62  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35.14 
 
 
162 aa  61.6  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  34.13 
 
 
159 aa  61.2  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.85 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  39.22 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  34.45 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  32.24 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  30.36 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  35.16 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  31.76 
 
 
266 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  29.07 
 
 
261 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  31.84 
 
 
248 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  31.82 
 
 
263 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  26.23 
 
 
342 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  29.17 
 
 
207 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  33.83 
 
 
263 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  35.04 
 
 
247 aa  57.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  32.46 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  29.89 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  35.43 
 
 
235 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  27.5 
 
 
255 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  30.34 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.95 
 
 
266 aa  56.6  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  31.07 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  29.68 
 
 
225 aa  55.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  31.16 
 
 
287 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  34.78 
 
 
266 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  30.34 
 
 
209 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  27.67 
 
 
247 aa  55.5  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  32.5 
 
 
239 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  36.07 
 
 
200 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  28.97 
 
 
229 aa  54.7  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  35.2 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  35.2 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  35.2 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  31.25 
 
 
267 aa  54.7  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  31.3 
 
 
270 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  40.62 
 
 
158 aa  54.3  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  54.3  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  27.68 
 
 
280 aa  54.3  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  25.7 
 
 
273 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  28.46 
 
 
243 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  31.16 
 
 
287 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  25.68 
 
 
351 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  30.43 
 
 
239 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  33.1 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  36.15 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  35.25 
 
 
283 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  36.44 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  26.09 
 
 
244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  26.09 
 
 
249 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  26.09 
 
 
249 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  26.09 
 
 
244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  31.25 
 
 
243 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  27.93 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  26.09 
 
 
244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  27.93 
 
 
249 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  32.03 
 
 
258 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4232  hypothetical protein  25.95 
 
 
365 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692535 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  26.09 
 
 
244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  27.93 
 
 
252 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>