More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2406 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2406  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0844  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1573  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6545  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.125421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4488  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  33.86 
 
 		 907 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1942  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8510  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0757  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 307 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2691  glycosyl transferase, family 2  35.14 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  35.64 
 
 		 884 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.78 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 		 472 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  29.67 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 417 aa  62  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 1120 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.65 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.46 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  34.78 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  31.52 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.46 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 622 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 		 441 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  34.15 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  32.48 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  32.08 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.48 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.42 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 1118 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.45 
 
 		 1157 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 345 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 		 1077 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  33.65 
 
 		 662 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  34.96 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.52 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.37 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  30.4 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  25.79 
 
 		 480 aa  55.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  30.71 
 
 		 469 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 428 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  37.5 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1810  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 513 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0885657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  33.65 
 
 		 520 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 1037 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 455 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.65 
 
 		 505 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2532  putative glycosyl transferase  29.77 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 1032 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 1002 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 398 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  27.73 
 
 		 435 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  40.22 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.31 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  31.58 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 476 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  31.82 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 479 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 597 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  28.33 
 
 		 1169 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0735  putative glycosyltransferase protein  32.61 
 
 		 368 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 479 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>