More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2376 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2376  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  100 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2973  5'-3' exonuclease  48.68 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0697  5'-3' exonuclease  42.63 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20067 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 897 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04579  exodeoxyribonuclease IX  40.87 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 897 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 897 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2057  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  38.26 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  36.61 
 
 		 899 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  36.84 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  36.86 
 
 		 480 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  33.91 
 
 		 921 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 930 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 906 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  32.69 
 
 		 928 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  31.97 
 
 		 931 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 888 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  31.86 
 
 		 902 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  31.51 
 
 		 918 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  32.37 
 
 		 928 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  32.37 
 
 		 928 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  32.37 
 
 		 928 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  32.37 
 
 		 928 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  31.86 
 
 		 902 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  32.28 
 
 		 932 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  40.09 
 
 		 482 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  36.51 
 
 		 924 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  32.28 
 
 		 932 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  34.63 
 
 		 951 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  32.28 
 
 		 932 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 928 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 928 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 928 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 928 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 928 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 928 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 928 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  32.05 
 
 		 928 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 829 aa  145  9e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  34.4 
 
 		 928 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 1047 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  31.75 
 
 		 944 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  32.98 
 
 		 929 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  32.29 
 
 		 922 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  32.29 
 
 		 922 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 1047 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  32.29 
 
 		 922 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  31.94 
 
 		 922 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 1024 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1158  exodeoxyribonuclease IX  36.44 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0177587 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  38.68 
 
 		 903 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  31.82 
 
 		 885 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  32.64 
 
 		 903 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  31.87 
 
 		 861 aa  143  4e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 912 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  31.78 
 
 		 875 aa  143  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  32.03 
 
 		 923 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 937 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  28.87 
 
 		 879 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 937 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  35.08 
 
 		 1016 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  31.58 
 
 		 929 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  36.8 
 
 		 484 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  36.61 
 
 		 973 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  34.28 
 
 		 957 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 935 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  28.52 
 
 		 879 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 921 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  35.21 
 
 		 934 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 921 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 921 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 1060 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 926 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 1047 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  30.74 
 
 		 875 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  35.07 
 
 		 893 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  34.93 
 
 		 979 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  30.45 
 
 		 934 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  32.63 
 
 		 934 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 892 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 891 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 911 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  31.21 
 
 		 945 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  41.71 
 
 		 899 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  36.48 
 
 		 474 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  41.71 
 
 		 899 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  29.23 
 
 		 879 aa  139  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.86 
 
 		 940 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  31.67 
 
 		 878 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 928 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 922 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5068  predicted protein  37.83 
 
 		 233 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0695806  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  34.41 
 
 		 930 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 909 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 879 aa  138  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 892 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 896 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  29.93 
 
 		 888 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  32.54 
 
 		 939 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  34.24 
 
 		 917 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>