More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0715 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 354 aa  696    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  81.64 
 
 		 354 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  68.36 
 
 		 344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  71.01 
 
 		 339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  66.97 
 
 		 352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  66.16 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  66.46 
 
 		 340 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  65.75 
 
 		 340 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  65.75 
 
 		 340 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  66.47 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  71 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  65.85 
 
 		 366 aa  421  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.99 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  68.5 
 
 		 339 aa  411  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  68.49 
 
 		 341 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  68.49 
 
 		 341 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  60.29 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.3 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  56.04 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  58.5 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  58.5 
 
 		 363 aa  384  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  54.95 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.42 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  59.05 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  58.98 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  57.74 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  57.74 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.01 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  55.97 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.97 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  59.47 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  59.17 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  59.77 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  60.37 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  56.25 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  60.06 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  56.94 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  59.09 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  59.39 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  59.09 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  59.7 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.08 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  61.15 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  61.15 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  61.15 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.63 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  54.9 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  57.4 
 
 		 358 aa  358  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  58.48 
 
 		 354 aa  358  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.93 
 
 		 337 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  56.32 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.16 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.98 
 
 		 358 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  58.65 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  57.57 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  49.31 
 
 		 369 aa  338  8e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  50.73 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  52.35 
 
 		 341 aa  329  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  48.88 
 
 		 367 aa  329  4e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.41 
 
 		 347 aa  317  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.86 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  49.84 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2293  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.36 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.75 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.57 
 
 		 348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  48.34 
 
 		 339 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.85 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.21 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  46.92 
 
 		 349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  48.35 
 
 		 462 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  48.57 
 
 		 341 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.43 
 
 		 364 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  48.73 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.35 
 
 		 331 aa  299  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  49.52 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  50.8 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  45.65 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  45.65 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  50.49 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1290  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.88 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  48.05 
 
 		 451 aa  295  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  45.06 
 
 		 340 aa  295  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  49.51 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  45.72 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  48.87 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  47.34 
 
 		 472 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  48.43 
 
 		 342 aa  292  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  48.56 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  50.99 
 
 		 341 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  47.77 
 
 		 348 aa  287  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.81 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>