More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0617 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  56.93 
 
 		 603 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  67.69 
 
 		 600 aa  826    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  100 
 
 		 611 aa  1229    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  50.68 
 
 		 600 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 599 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  49.23 
 
 		 628 aa  534  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  47.8 
 
 		 605 aa  528  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  47.74 
 
 		 583 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  46.74 
 
 		 568 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  40.75 
 
 		 625 aa  429  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  45.32 
 
 		 583 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  43.03 
 
 		 586 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  42.86 
 
 		 596 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  43.19 
 
 		 596 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  42.5 
 
 		 585 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  37.52 
 
 		 599 aa  396  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  37.69 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  37.48 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  42.39 
 
 		 585 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  34.75 
 
 		 571 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  37.85 
 
 		 613 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  36.99 
 
 		 600 aa  331  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  33.39 
 
 		 601 aa  313  5.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.69 
 
 		 601 aa  310  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  33.22 
 
 		 610 aa  309  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  31.37 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.98 
 
 		 564 aa  289  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.78 
 
 		 564 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  30.02 
 
 		 586 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.3 
 
 		 564 aa  281  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.43 
 
 		 564 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  35.15 
 
 		 611 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  35.15 
 
 		 611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  29.69 
 
 		 586 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  32.91 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  30.66 
 
 		 607 aa  263  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  34.77 
 
 		 626 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  30.17 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  32.14 
 
 		 603 aa  257  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  29.76 
 
 		 612 aa  256  8e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  32.35 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  31.92 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  30.31 
 
 		 613 aa  246  8e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  32 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  28.01 
 
 		 552 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  29.5 
 
 		 676 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.71 
 
 		 600 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  29.56 
 
 		 618 aa  223  7e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  32.32 
 
 		 599 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  31.91 
 
 		 613 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  32.01 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  31.42 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  32.35 
 
 		 578 aa  214  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  31.42 
 
 		 651 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  29.84 
 
 		 600 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  32.35 
 
 		 575 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  32.11 
 
 		 607 aa  213  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 613 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  31.91 
 
 		 746 aa  210  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  33.9 
 
 		 546 aa  210  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  33.14 
 
 		 1040 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  31.78 
 
 		 658 aa  208  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 616 aa  207  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  29.63 
 
 		 592 aa  207  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.52 
 
 		 971 aa  207  6e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  30.78 
 
 		 606 aa  206  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.29 
 
 		 590 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.48 
 
 		 594 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.86 
 
 		 976 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  28.01 
 
 		 593 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  30.29 
 
 		 607 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  33.26 
 
 		 764 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  45.45 
 
 		 591 aa  204  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.6 
 
 		 606 aa  204  5e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.77 
 
 		 574 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.31 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.77 
 
 		 574 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.09 
 
 		 727 aa  204  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  30.16 
 
 		 594 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  27.8 
 
 		 608 aa  203  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  29.41 
 
 		 613 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.6 
 
 		 720 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.15 
 
 		 578 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  29.1 
 
 		 590 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.1 
 
 		 602 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.15 
 
 		 578 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.81 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  25.59 
 
 		 610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  30.49 
 
 		 596 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  30.49 
 
 		 631 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.47 
 
 		 587 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  30.49 
 
 		 596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  29.02 
 
 		 590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.79 
 
 		 593 aa  201  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.44 
 
 		 592 aa  200  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.33 
 
 		 980 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.96 
 
 		 738 aa  200  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  29.66 
 
 		 590 aa  200  7e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  30 
 
 		 589 aa  199  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  29.63 
 
 		 603 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>