More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0567 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 
188 aa  374  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  49.73 
 
 
181 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  49.2 
 
 
184 aa  171  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  45.45 
 
 
187 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
208 aa  154  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  41.62 
 
 
170 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.62 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.62 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  41.62 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  41.62 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.62 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.62 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.62 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.84 
 
 
169 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.84 
 
 
169 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.46 
 
 
176 aa  141  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  41.08 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.62 
 
 
167 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  37.84 
 
 
170 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.84 
 
 
170 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.84 
 
 
170 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  38.33 
 
 
180 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  37.84 
 
 
170 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  36.9 
 
 
169 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  50.86 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.84 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  39.23 
 
 
175 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  51.28 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  50.86 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.41 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0950  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.86 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.660653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  50.43 
 
 
180 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  52.63 
 
 
167 aa  130  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.68 
 
 
169 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  48.72 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  50 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  38.5 
 
 
187 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  58.25 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.31 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  37.43 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.31 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  49.57 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.44 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3118  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.41 
 
 
172 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.396871  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  47.46 
 
 
163 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.87 
 
 
172 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
163 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  45.38 
 
 
175 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1747  OmpA domain-containing protein  37.5 
 
 
178 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000284949  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.7 
 
 
173 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1786  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 
178 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000724127  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1743  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 
178 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000604821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2537  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 
178 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000399266  hitchhiker  0.000124284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  124  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.33 
 
 
177 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  46.55 
 
 
148 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  40.21 
 
 
188 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  36.46 
 
 
174 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
178 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
178 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
178 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.33 
 
 
184 aa  120  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  54.37 
 
 
185 aa  120  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.24 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.06 
 
 
172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.24 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000375397  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.4 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  39.59 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.24 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1608  OmpA domain-containing protein  49.52 
 
 
178 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000267608  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  48.11 
 
 
211 aa  119  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.96 
 
 
180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.88 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2938  OmpA/MotB  41.18 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00109822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  57 
 
 
166 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.43 
 
 
168 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  58 
 
 
179 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  48.57 
 
 
180 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  57 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  57 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  57 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  50 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  50 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.78 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  56 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  56 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.15 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  34.69 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1280  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  50.48 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000137851  hitchhiker  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  33.5 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  56 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  34.24 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1858  OmpA domain-containing protein  34.95 
 
 
179 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000707454  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  56 
 
 
165 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  56 
 
 
166 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  56 
 
 
166 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  32.07 
 
 
174 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.07 
 
 
173 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>