More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2605 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 180 aa  373  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 217 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 207 aa  94.7  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  38.79 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.72 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 216 aa  87  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 214 aa  87  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.04 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 216 aa  85.1  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  30.57 
 
 		 199 aa  84.3  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  33.51 
 
 		 196 aa  84.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  26.97 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  28.36 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.02 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.02 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  27.57 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 220 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.59 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  38.41 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  31.46 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.81 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  31.21 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.49 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.34 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  33.13 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  33.13 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  33.13 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  33.13 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  29.61 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  26.46 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30.23 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.34 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 240 aa  74.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.22 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  31.49 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.73 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>