More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0856 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0856  L-fuculose phosphate aldolase, putative  100 
 
 		 395 aa  821    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.668343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 		 217 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  36.02 
 
 		 219 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  36.02 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  35.52 
 
 		 220 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  34.62 
 
 		 214 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  38.15 
 
 		 212 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  34.08 
 
 		 214 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  33.33 
 
 		 216 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.15 
 
 		 214 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  28.84 
 
 		 222 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  32.79 
 
 		 753 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  30.85 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  35.12 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.72 
 
 		 212 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  33.71 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.13 
 
 		 212 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  34.07 
 
 		 214 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 		 214 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  32.22 
 
 		 211 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  32.4 
 
 		 215 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  33.87 
 
 		 236 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  34.39 
 
 		 215 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  33.7 
 
 		 212 aa  97.1  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 212 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  34.23 
 
 		 220 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  30.86 
 
 		 215 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.16 
 
 		 217 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  33.52 
 
 		 237 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  35.29 
 
 		 213 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  28.96 
 
 		 213 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0402  class II aldolase/adducin family protein  34.25 
 
 		 223 aa  89.7  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1019  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.79 
 
 		 230 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  32.79 
 
 		 229 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2887  class II aldolase/adducin family protein  33.71 
 
 		 222 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  31.38 
 
 		 216 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  30.77 
 
 		 218 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.37 
 
 		 214 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0872  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.29 
 
 		 223 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0223  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.25 
 
 		 226 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 225 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  32.96 
 
 		 220 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.29 
 
 		 213 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  31.02 
 
 		 213 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  28.22 
 
 		 229 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.17 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  29.9 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0497  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.32 
 
 		 242 aa  85.5  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.591725 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.4 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  30.9 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  29.83 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.74 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  29.83 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  32.54 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4089  class II aldolase/adducin family protein  33.92 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  31.07 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0380  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.67 
 
 		 231 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  31.47 
 
 		 212 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  28.96 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  29.41 
 
 		 213 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  30.51 
 
 		 214 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  29.95 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2754  class II aldolase/adducin family protein  31.21 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172174  decreased coverage  0.00000252698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2898  class II aldolase/adducin family protein  32.82 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.38221  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  31.11 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06950  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  33.94 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  29.63 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3273  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.82 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0199942 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  31.07 
 
 		 221 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0855  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.53 
 
 		 234 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.121806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3995  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.24 
 
 		 233 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0420304  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  29.21 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  31.11 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  28.25 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0325  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.53 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  27.32 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  31.79 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3928  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000124129  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0750  class II aldolase/adducin family protein  34.52 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5230  L-fuculose-phosphate aldolase  30 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2730  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.2 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.29753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  31.79 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1120  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.98 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  30.11 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  25.53 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  31.11 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  31.79 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.27 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  28.25 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  31.21 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  31.21 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  29.35 
 
 		 215 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  31.21 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>