217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0773 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0773  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  24.23 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.21 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  24.23 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  26.24 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.19 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.19 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  24.35 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.23 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.91 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.91 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.91 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.58 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  23.53 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.91 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.58 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.91 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  25.42 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  25.41 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  24.78 
 
 
252 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  27.19 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  24.77 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  24.54 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  24.24 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.706269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  22.08 
 
 
247 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  24.29 
 
 
502 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  24.29 
 
 
502 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.03 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.63 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  22.66 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.89 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.89 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.89 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  25.27 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.89 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.89 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.89 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  23 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.03 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.03 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.03 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  24.03 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.03 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  25.1 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.03 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.03 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.03 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  25.1 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  26.15 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  25.83 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  21.91 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  27.4 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.61 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  23.18 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  26.14 
 
 
264 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.14 
 
 
264 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
2654 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.89 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  22.56 
 
 
490 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  24.31 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  23.72 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  20.98 
 
 
501 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.08 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.34 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  22.79 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  25.94 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  26.48 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  26.48 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  30.22 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.53 
 
 
485 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.53 
 
 
485 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  26.44 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  22.31 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  23.28 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  22.33 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  22.31 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>