272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13441 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  100 
 
 
295 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  58.33 
 
 
305 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  58.33 
 
 
305 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  58.33 
 
 
305 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  54.93 
 
 
309 aa  328  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  57.99 
 
 
308 aa  319  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  54.01 
 
 
300 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  54.01 
 
 
300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  54.87 
 
 
309 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  55.63 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  54.39 
 
 
301 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  51.4 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  51.4 
 
 
317 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  52.07 
 
 
316 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  51.75 
 
 
317 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  51.05 
 
 
317 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  51.69 
 
 
310 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  53.19 
 
 
301 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  53.21 
 
 
309 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  51.57 
 
 
314 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  52.26 
 
 
318 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  50.69 
 
 
316 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  52.26 
 
 
317 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  50.17 
 
 
306 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  52.13 
 
 
305 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  52.94 
 
 
305 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  52.48 
 
 
301 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  50.35 
 
 
303 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  49.82 
 
 
316 aa  279  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  48.78 
 
 
333 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  46.53 
 
 
381 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  46.05 
 
 
312 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  46.34 
 
 
304 aa  269  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  50.35 
 
 
297 aa  265  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  46.37 
 
 
298 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  47.06 
 
 
319 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  48.25 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  48.06 
 
 
307 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  46.8 
 
 
306 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  46.74 
 
 
318 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  45.94 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  40.96 
 
 
316 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  42.72 
 
 
315 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  44.3 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  43.75 
 
 
315 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  43.42 
 
 
315 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  41.9 
 
 
309 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  42.86 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  42.67 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  42.16 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  42.02 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  42.67 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  42.81 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  40.33 
 
 
318 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  40.26 
 
 
323 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.58 
 
 
321 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  40.58 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  36.07 
 
 
292 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  36.33 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  36.33 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  36.33 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  36.33 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  36.33 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  40.5 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  38.93 
 
 
306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  40.5 
 
 
335 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  36.33 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  35.97 
 
 
292 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  37.41 
 
 
281 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  38.33 
 
 
306 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  40.14 
 
 
277 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  36.71 
 
 
281 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  39.13 
 
 
277 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  39.65 
 
 
295 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.08 
 
 
283 aa  168  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  37.41 
 
 
281 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  38.08 
 
 
283 aa  168  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.08 
 
 
283 aa  168  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.08 
 
 
283 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.08 
 
 
283 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.08 
 
 
283 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  36.59 
 
 
282 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.08 
 
 
283 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.08 
 
 
283 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  36.18 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  38.18 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  37.81 
 
 
282 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  38.73 
 
 
282 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  37.59 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  36.59 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  38.46 
 
 
272 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  39.72 
 
 
277 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  37.85 
 
 
282 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  36.79 
 
 
277 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  36.2 
 
 
280 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  36.21 
 
 
299 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  36.43 
 
 
277 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  36.2 
 
 
277 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  38.33 
 
 
282 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  36.24 
 
 
282 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>