46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11532 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  566  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.23 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.67 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  35.81 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  27.01 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.91 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.93 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.71 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.23 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  27.82 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  25.99 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  26.75 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.3 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.3 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  30.7 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.62 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.93 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.7 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.45 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.77 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  22.91 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  25.77 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.29 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.7 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  25.57 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.43 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  27.81 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.51 
 
 		 288 aa  45.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4193  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 681 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  28.85 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3596  hypothetical protein  25.6 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.56 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.04 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.04 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.05 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.04 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.36 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  24.43 
 
 		 299 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.76 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.04 
 
 		 270 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 		 278 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 		 273 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>