More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2570 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2570  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
402 aa  813    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56306  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3195  tyrosyl-tRNA synthetase  71.32 
 
 
407 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0445  tyrosyl-tRNA synthetase  71.39 
 
 
405 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2901  tyrosyl-tRNA synthetase  71.32 
 
 
407 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1292  tyrosyl-tRNA synthetase  72.57 
 
 
406 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0857  tyrosyl-tRNA synthetase  68.18 
 
 
403 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.16761  hitchhiker  0.00258196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0925  tyrosyl-tRNA synthetase  67.08 
 
 
398 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2102  tyrosyl-tRNA synthetase  65.35 
 
 
415 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0567  tyrosyl-tRNA synthetase  65.76 
 
 
415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05611  tyrosyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17561  tyrosyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 
415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0900  tyrosyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 
415 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13831  tyrosyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
415 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2067  tyrosyl-tRNA synthetase  64.76 
 
 
418 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14901  tyrosyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
412 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15291  tyrosyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 
412 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15151  tyrosyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1427  tyrosyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 
413 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
407 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
432 aa  346  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
406 aa  345  6e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
398 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
404 aa  338  8e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
413 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
410 aa  335  9e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
407 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 
400 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  46.93 
 
 
438 aa  333  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
412 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
410 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
395 aa  326  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
396 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
402 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
413 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
395 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
400 aa  323  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
399 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
410 aa  322  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
395 aa  322  8e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
395 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
392 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
421 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  43 
 
 
403 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
410 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  43 
 
 
403 aa  319  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
421 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
401 aa  318  9e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
392 aa  317  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
398 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
405 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
407 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
401 aa  316  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
399 aa  316  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
413 aa  316  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
398 aa  316  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
408 aa  315  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4045  tyrosyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
410 aa  316  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
413 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
398 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  42 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
410 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
399 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
399 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
403 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
399 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
404 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
397 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
401 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
399 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
401 aa  309  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
403 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3150  tyrosyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
424 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0347035  hitchhiker  0.00193972 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
398 aa  308  8e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0506  tyrosyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>