45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1803 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  100 
 
 		 304 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  66.67 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  47.68 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  45.87 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  44.04 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  43.71 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  36.25 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13761  AEC family transporter  37.5 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13681  AEC family transporter  38.11 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.02494  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13471  AEC family transporter  36.51 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.89 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.2 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  22.98 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  23.58 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.7 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  28.07 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  22.88 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.82 
 
 		 328 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  24.88 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  21.53 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  22.76 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  26.6 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.39 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  20.71 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  32.5 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  30.43 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0718  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  28.19 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  24.22 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  28.37 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  22.54 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  28.37 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  31.55 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  27.31 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  23.88 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  20.48 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  35.9 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  41.43 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>