More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1878 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 599 aa  1239    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  70.34 
 
 		 606 aa  863    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  59.01 
 
 		 596 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  51.11 
 
 		 596 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  39.26 
 
 		 576 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  41.23 
 
 		 574 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 		 574 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 		 576 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 		 577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  38.33 
 
 		 586 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 		 621 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  37.8 
 
 		 580 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  37.28 
 
 		 569 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  37.24 
 
 		 589 aa  415  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 		 572 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  39.41 
 
 		 579 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 		 577 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  37.24 
 
 		 574 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 		 574 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  37.79 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 		 585 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  36.9 
 
 		 591 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  33.33 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 548 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 605 aa  272  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  30.58 
 
 		 571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  30.2 
 
 		 563 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  30.46 
 
 		 555 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  29.55 
 
 		 553 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  29.73 
 
 		 529 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  31.34 
 
 		 555 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  29.69 
 
 		 595 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  28.75 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  30.11 
 
 		 556 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  30.02 
 
 		 559 aa  248  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  29.93 
 
 		 556 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  29.93 
 
 		 556 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  29.72 
 
 		 554 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  31.81 
 
 		 533 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  28.02 
 
 		 556 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  28.04 
 
 		 565 aa  230  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 		 573 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  27.16 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  27.65 
 
 		 582 aa  194  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  26.96 
 
 		 667 aa  187  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  25.6 
 
 		 580 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 700 aa  172  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  30.95 
 
 		 705 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  32.43 
 
 		 325 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.36 
 
 		 614 aa  136  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.75 
 
 		 598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 		 666 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 776 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 		 673 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.67 
 
 		 658 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 328 aa  127  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  32.19 
 
 		 638 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 		 625 aa  127  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.57 
 
 		 591 aa  126  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 439 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.04 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.06 
 
 		 653 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.46 
 
 		 666 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  29.55 
 
 		 593 aa  124  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  28.36 
 
 		 620 aa  123  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.36 
 
 		 715 aa  123  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.55 
 
 		 916 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.32 
 
 		 668 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  30.89 
 
 		 656 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  30.16 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.6 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 761 aa  120  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.93 
 
 		 1044 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 		 612 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  32.06 
 
 		 586 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  33.03 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.62 
 
 		 647 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  31.09 
 
 		 625 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.71 
 
 		 746 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  32.57 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 628 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  32.11 
 
 		 436 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  31.65 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  29.76 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 		 982 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.63 
 
 		 707 aa  117  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 		 657 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 468 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 		 657 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 		 657 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 		 683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>