More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1035 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2022  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.06 
 
 		 721 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556137  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2633  hypothetical protein  53.8 
 
 		 745 aa  772    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2503  hypothetical protein  53.53 
 
 		 745 aa  766    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3884  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  60 
 
 		 735 aa  841    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1294  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  55.74 
 
 		 727 aa  780    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2640  Transketolase domain protein  50.85 
 
 		 759 aa  686    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1956  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.06 
 
 		 721 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1045  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  56.89 
 
 		 738 aa  830    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3017  transketolase, central region  76.34 
 
 		 761 aa  1209    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2962  transketolase, central region  60 
 
 		 733 aa  870    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0290304  normal  0.0965541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2727  transketolase, central region  55.76 
 
 		 727 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.556431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0901  transketolase, central region  72.63 
 
 		 763 aa  1151    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.542357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1035  transketolase central region  100 
 
 		 747 aa  1545    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2566  putative bifunctional enzyme  51.55 
 
 		 743 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104347  hitchhiker  0.000000000000144647 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2954  transketolase, central region  55.24 
 
 		 727 aa  787    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.998903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2795  transketolase, central region  70.87 
 
 		 761 aa  1097    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2156  transketolase central region  46.89 
 
 		 790 aa  631  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1976  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.21 
 
 		 687 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6420  2-oxoisovalerate dehydrogenase  46.64 
 
 		 736 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3610  transketolase domain-containing protein  41.96 
 
 		 805 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3370  transketolase domain-containing protein  41.62 
 
 		 792 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  27.69 
 
 		 736 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  29.7 
 
 		 710 aa  217  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  29.87 
 
 		 678 aa  211  4e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  27.72 
 
 		 688 aa  194  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1538  Transketolase central region  27.05 
 
 		 681 aa  181  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.244278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3123  transketolase domain-containing protein  26.66 
 
 		 701 aa  178  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  33.72 
 
 		 320 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  27.32 
 
 		 692 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  35.09 
 
 		 325 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  29.86 
 
 		 692 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  25.98 
 
 		 791 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  28.15 
 
 		 693 aa  171  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  25.29 
 
 		 659 aa  165  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  32.66 
 
 		 330 aa  162  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  31.87 
 
 		 326 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  34.34 
 
 		 320 aa  161  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  32.15 
 
 		 326 aa  161  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  25.96 
 
 		 702 aa  161  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.56 
 
 		 325 aa  160  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  33.73 
 
 		 320 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  31.56 
 
 		 325 aa  160  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  31.56 
 
 		 325 aa  160  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  31.69 
 
 		 322 aa  158  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.86 
 
 		 341 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  34.12 
 
 		 345 aa  157  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.86 
 
 		 337 aa  157  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  33.13 
 
 		 320 aa  157  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3464  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.83 
 
 		 352 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  32.3 
 
 		 327 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  26.42 
 
 		 657 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  30.18 
 
 		 325 aa  156  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  32.94 
 
 		 326 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  32 
 
 		 325 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.88 
 
 		 325 aa  154  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  29.88 
 
 		 325 aa  154  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.88 
 
 		 325 aa  154  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.88 
 
 		 325 aa  154  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  29.88 
 
 		 325 aa  154  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.88 
 
 		 325 aa  154  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.88 
 
 		 325 aa  154  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.44 
 
 		 324 aa  154  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  35.05 
 
 		 320 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  33.44 
 
 		 324 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  32.84 
 
 		 346 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  32.84 
 
 		 346 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  31.81 
 
 		 342 aa  153  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  33.44 
 
 		 324 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  29.88 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  31.96 
 
 		 334 aa  153  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  34.94 
 
 		 328 aa  153  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  32.8 
 
 		 327 aa  153  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  32.84 
 
 		 346 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  24.26 
 
 		 668 aa  152  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  31.44 
 
 		 324 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  32.07 
 
 		 333 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.88 
 
 		 325 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  32.8 
 
 		 327 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  32.64 
 
 		 326 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  29.15 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  31.14 
 
 		 324 aa  152  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  26.1 
 
 		 709 aa  152  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  31.66 
 
 		 326 aa  152  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  32.36 
 
 		 333 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  33.33 
 
 		 337 aa  151  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  33.12 
 
 		 324 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  30.77 
 
 		 325 aa  151  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  34.05 
 
 		 336 aa  150  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1135  transketolase central region  32.65 
 
 		 347 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.770864  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1124  transketolase, central region  32.65 
 
 		 347 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  25.04 
 
 		 659 aa  150  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  27.18 
 
 		 680 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  32.15 
 
 		 324 aa  150  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  32.26 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  30.56 
 
 		 339 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  26.23 
 
 		 617 aa  150  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3743  transketolase central region  32.93 
 
 		 352 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.530888 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  33.99 
 
 		 327 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  32.13 
 
 		 328 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  33.33 
 
 		 340 aa  148  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>