135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2062 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  100 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  43.43 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  44.05 
 
 		 101 aa  72  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  39 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  34.69 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  28.57 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 405 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.52 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.69 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  31.82 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.7 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 436 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  31.03 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  31.03 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 250 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.25 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.39 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  32.91 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.7 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  30.3 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  30.3 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  36 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 138 aa  48.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  30.68 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.26 
 
 		 437 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  30.93 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  27.47 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  27.47 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.93 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  30 
 
 		 782 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.1 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.93 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.7 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.27 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  35.53 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.1 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5015  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  26.26 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.93 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  31.25 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.9 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  24.69 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>