More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1349 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 334 aa  672    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  44.61 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  41.49 
 
 		 364 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  42.69 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  41.67 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  40.24 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  39.27 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  36.09 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  35.22 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  35.82 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  35.52 
 
 		 378 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  35.52 
 
 		 366 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  35.52 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  35.22 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  35.52 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  34.52 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  35.22 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  34.93 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  34.93 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  36.97 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  34.14 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  34.14 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  35.82 
 
 		 360 aa  185  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  38.08 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  40 
 
 		 280 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  34.63 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  34.44 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  37.45 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  37.69 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  32.93 
 
 		 354 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  36.68 
 
 		 286 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  36.29 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.94 
 
 		 742 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  30.33 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  40 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  37.79 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  35.98 
 
 		 291 aa  159  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  35.58 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  36.01 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  37.21 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  37.69 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  36.72 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  35.8 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  31.63 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.83 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  37.07 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  35.63 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  33.68 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.9 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  34.77 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  35.43 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.08 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  38.49 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.71 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  33.95 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.08 
 
 		 748 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  37.65 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  34.08 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.59 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  31.91 
 
 		 280 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  32.64 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.47 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  36.47 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  36.47 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.1 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.84 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  36.41 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  35.02 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  38.56 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  36.4 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.94 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.47 
 
 		 746 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.71 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.13 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  36.08 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  31.73 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  38.43 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.18 
 
 		 746 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  37.4 
 
 		 289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 		 735 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  34.38 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  33.46 
 
 		 535 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.71 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  33.59 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.21 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  37.66 
 
 		 313 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.34 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.84 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  33.59 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.37 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.45 
 
 		 746 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 		 534 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>