More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3928 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 
255 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  70.52 
 
 
269 aa  358  5e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  65.31 
 
 
279 aa  280  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.98 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.43 
 
 
272 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  48.22 
 
 
323 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.84 
 
 
274 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.79 
 
 
254 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  49.4 
 
 
271 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  46.21 
 
 
270 aa  224  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.94 
 
 
264 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  46.75 
 
 
271 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.1 
 
 
300 aa  220  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.66 
 
 
275 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  51.01 
 
 
272 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  49.2 
 
 
267 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  47.83 
 
 
288 aa  218  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.38 
 
 
275 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.58 
 
 
263 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.59 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.72 
 
 
263 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.38 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  47.37 
 
 
269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.25 
 
 
263 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.35 
 
 
266 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  47.37 
 
 
282 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  45.04 
 
 
250 aa  209  5e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.35 
 
 
266 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.35 
 
 
266 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.79 
 
 
269 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  50.61 
 
 
271 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  44.8 
 
 
253 aa  207  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.75 
 
 
266 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  48.25 
 
 
274 aa  205  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  48.25 
 
 
274 aa  205  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  44.03 
 
 
251 aa  203  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  44.96 
 
 
249 aa  201  9e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.53 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.75 
 
 
287 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.52 
 
 
280 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  40.91 
 
 
247 aa  191  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  45.29 
 
 
241 aa  188  8e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  39.55 
 
 
299 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  41.96 
 
 
289 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.96 
 
 
289 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.04 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.96 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.34 
 
 
468 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  37.74 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.43 
 
 
253 aa  182  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  41.1 
 
 
266 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  38.71 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.35 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.02 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  39.11 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  38.71 
 
 
249 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  42.21 
 
 
260 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  39.61 
 
 
251 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.87 
 
 
260 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.25 
 
 
248 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.02 
 
 
251 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.88 
 
 
259 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  41.88 
 
 
259 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.1 
 
 
251 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.1 
 
 
251 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.1 
 
 
251 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.28 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  37.94 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.7 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.34 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.5 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  38.41 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.6 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.6 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.6 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.6 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.6 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.44 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  39.92 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  40.48 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  38.08 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.08 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.08 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.08 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.08 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.08 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.08 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.08 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  38.08 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  39.13 
 
 
249 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  38.96 
 
 
266 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  40.98 
 
 
269 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.79 
 
 
252 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  40.57 
 
 
250 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  37.25 
 
 
252 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.86 
 
 
250 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.94 
 
 
253 aa  168  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.7 
 
 
249 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.89 
 
 
255 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  37.05 
 
 
257 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>