259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3787 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3787  thymidylate synthase  100 
 
 		 308 aa  638    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1977  thymidylate synthase  64.26 
 
 		 316 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1332  thymidylate synthase  65.36 
 
 		 320 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0118279  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0846  thymidylate synthase  59.8 
 
 		 298 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2044  thymidylate synthase  58.82 
 
 		 298 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0390  thymidylate synthase  57.84 
 
 		 298 aa  363  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.137762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  49.01 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  49.34 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  49.34 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  49.01 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  49.01 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  49.01 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  49.01 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  49.01 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  49.01 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  49.01 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  48.01 
 
 		 264 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  48.01 
 
 		 264 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  48.01 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  48.01 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  46.36 
 
 		 264 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  46.36 
 
 		 264 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0544  thymidylate synthase  46.03 
 
 		 264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.249699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  269  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  47 
 
 		 280 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  42.38 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  46.67 
 
 		 264 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  42.07 
 
 		 318 aa  265  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  42.07 
 
 		 318 aa  265  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  42.07 
 
 		 318 aa  265  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  42.07 
 
 		 318 aa  265  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  46.36 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  42.07 
 
 		 318 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  42.07 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  42.07 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  42.07 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  48 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  42.07 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  49.03 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  47.18 
 
 		 274 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  48.01 
 
 		 264 aa  263  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  41.77 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  46.03 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0572  thymidylate synthase  44.13 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  48 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  48 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  48 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  45.7 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2986  thymidylate synthase  45.57 
 
 		 277 aa  258  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2380  thymidylate synthase  47.67 
 
 		 266 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  45.93 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  45.03 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  47.67 
 
 		 267 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 286 aa  257  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  45.54 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  43.71 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  46.53 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  46.2 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1260  thymidylate synthase  47.08 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000721083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  44.37 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  45.36 
 
 		 264 aa  255  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  42.77 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  254  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  44.7 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  45.4 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  46.51 
 
 		 271 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  45.36 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  45.18 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  46.03 
 
 		 264 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  46.67 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5043  thymidylate synthase  43.49 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  46.36 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  46.67 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  46.03 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  46.36 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  44.37 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1030  thymidylate synthase  45.33 
 
 		 266 aa  252  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  44.62 
 
 		 277 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>