More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2266 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2266  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 545 aa  1109    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0318  putative AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00246923  normal  0.308264 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1470  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 530 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  36.28 
 
 		 568 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  35.66 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  34.81 
 
 		 552 aa  320  5e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  35.27 
 
 		 552 aa  319  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  35.41 
 
 		 552 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.81 
 
 		 549 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  34.5 
 
 		 560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  34.2 
 
 		 549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  34.2 
 
 		 549 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 550 aa  311  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  34.07 
 
 		 549 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.49 
 
 		 552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 		 549 aa  309  8e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 553 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  33.03 
 
 		 547 aa  301  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  32.96 
 
 		 544 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  34.09 
 
 		 550 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 843 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  33.7 
 
 		 587 aa  290  7e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 554 aa  290  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  35.23 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 563 aa  286  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  31.62 
 
 		 602 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 525 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 520 aa  282  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  34.73 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  34.92 
 
 		 575 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  31.43 
 
 		 584 aa  281  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  36.45 
 
 		 564 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  32.77 
 
 		 561 aa  281  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  31.68 
 
 		 596 aa  280  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  32.02 
 
 		 549 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  34.92 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 550 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 566 aa  277  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 576 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  34.19 
 
 		 576 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  34 
 
 		 601 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.61 
 
 		 828 aa  275  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  34.48 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  33.7 
 
 		 570 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 571 aa  273  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  35.1 
 
 		 575 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  34.84 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  32.91 
 
 		 571 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  34.84 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  32.03 
 
 		 549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  35.51 
 
 		 575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.18 
 
 		 514 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  34.92 
 
 		 575 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  34.92 
 
 		 575 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  35.89 
 
 		 549 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 546 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  33.7 
 
 		 546 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  32.91 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  32.09 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  35.33 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  35.12 
 
 		 565 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 630 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  34 
 
 		 575 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  32.97 
 
 		 578 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 566 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 560 aa  266  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  31.83 
 
 		 548 aa  266  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 564 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2746  putative long chain fatty acid CoA ligase  33.27 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 566 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  31.52 
 
 		 548 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 571 aa  264  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 564 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.94 
 
 		 579 aa  264  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 558 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  32.25 
 
 		 605 aa  263  6e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  33.88 
 
 		 552 aa  263  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.88 
 
 		 560 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 544 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.93 
 
 		 605 aa  261  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 540 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0354  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 576 aa  261  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 540 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  33.69 
 
 		 560 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 547 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 		 565 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 540 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 560 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  33.04 
 
 		 557 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.3 
 
 		 564 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  34.13 
 
 		 562 aa  257  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 546 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  33.57 
 
 		 562 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  31.42 
 
 		 572 aa  256  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>