More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2063 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2063  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 365 aa  728    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  65.47 
 
 		 371 aa  471  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  64.46 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  64.46 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  64.46 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  64.46 
 
 		 371 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  64.46 
 
 		 371 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  64.46 
 
 		 371 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  64.46 
 
 		 371 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  63.09 
 
 		 371 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  64.19 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  63.19 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  62.4 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  60.33 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  61.71 
 
 		 371 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  64.19 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  63.36 
 
 		 371 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  63.09 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  63.64 
 
 		 371 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  63.36 
 
 		 371 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  64.29 
 
 		 373 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  62.67 
 
 		 372 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  61.43 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  61.16 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  61.16 
 
 		 373 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  61 
 
 		 372 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  58.13 
 
 		 371 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  58.13 
 
 		 371 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  66.3 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  62.43 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  61.39 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  57.85 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  61.22 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  61.98 
 
 		 371 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  61.71 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  64.35 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0473  L-alanine dehydrogenase  66.21 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  63.23 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  61.98 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  61.71 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  61.16 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  63.09 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  62.26 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  61.16 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  60.88 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  55.37 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0558  alanine dehydrogenase  63.51 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.87759  normal  0.209047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  60.33 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  62.29 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  56.47 
 
 		 371 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  58.52 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  58.24 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 		 372 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  60.45 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  64.89 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  58.17 
 
 		 377 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1682  L-alanine dehydrogenase  65.29 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  59.56 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  62.4 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  54.87 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  60.45 
 
 		 372 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  55.62 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  56.35 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  56.47 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  54.27 
 
 		 373 aa  384  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  52.75 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  61.5 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  56.91 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  56.47 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  56.2 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  59.89 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  55.77 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0039  alanine dehydrogenase  60.06 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  54.27 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  53.44 
 
 		 374 aa  378  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1536  alanine dehydrogenase  60.06 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390556  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1449  alanine dehydrogenase  60.06 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.283276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  56.75 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  52.34 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  57.58 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0922  alanine dehydrogenase  60.06 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  56.47 
 
 		 370 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  59.39 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  52.63 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  54.57 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0723  L-alanine dehydrogenase  60.66 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  55.22 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  56.47 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  54.55 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2378  alanine dehydrogenase  60.39 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>