225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1246 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  961    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  60.55 
 
 		 469 aa  538  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  57.17 
 
 		 477 aa  512  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  57.14 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  55.25 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  56.46 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  54.83 
 
 		 498 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  53.83 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  55.11 
 
 		 475 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  54.62 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  40.73 
 
 		 473 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  40.73 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  38.96 
 
 		 485 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  39.66 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  44.37 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  41.46 
 
 		 492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  40 
 
 		 475 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  40.88 
 
 		 482 aa  303  6.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  40.43 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  40.35 
 
 		 493 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  38.72 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  37.29 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  36.96 
 
 		 486 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  36.96 
 
 		 540 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  37.05 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  36.96 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  33.12 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  32.65 
 
 		 489 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  34.32 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  37.96 
 
 		 488 aa  197  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  39.24 
 
 		 494 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  32.35 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  41.46 
 
 		 492 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  35.17 
 
 		 497 aa  192  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  35.34 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  36.21 
 
 		 481 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  39.14 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  38.35 
 
 		 481 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  38.35 
 
 		 481 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  35.1 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  36.69 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  36.69 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  38.11 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  34.1 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  34.1 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  34.1 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  35.73 
 
 		 481 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  35.13 
 
 		 473 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  39.27 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  33.9 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  35.53 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  36.88 
 
 		 488 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  35.1 
 
 		 510 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  36.61 
 
 		 491 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  36.53 
 
 		 492 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  39.76 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  34.65 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  36.27 
 
 		 505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  38.38 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  36.13 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  37.72 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2019  hypothetical protein  39.09 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  37.23 
 
 		 494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  37.67 
 
 		 498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  37.17 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  32.71 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  36.51 
 
 		 486 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  36.51 
 
 		 486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  36.77 
 
 		 483 aa  183  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  36.54 
 
 		 488 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  38.54 
 
 		 485 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  35.14 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  37.86 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  34.32 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  35.88 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  35.88 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  35.88 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  40.76 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  33.98 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  39.11 
 
 		 498 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  33.51 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  35.88 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  35.88 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  31.5 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  34.8 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  32.28 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  33.43 
 
 		 500 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  34.56 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  32.28 
 
 		 485 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  35.17 
 
 		 496 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  32.85 
 
 		 496 aa  180  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  35.76 
 
 		 491 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  35.87 
 
 		 524 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  30.77 
 
 		 522 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  34.24 
 
 		 483 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  36.42 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  35.05 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  33.99 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  35.88 
 
 		 488 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  39.84 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>