64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1214 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  50.54 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  47.67 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  45.35 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  47.06 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  44.32 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  47.67 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  44.71 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  66.67 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  40.62 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  40.62 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  40.62 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  52.54 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  42.86 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  39.53 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  48.53 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  40.79 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  37.65 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  43.42 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  53.33 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  62.16 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  62.16 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  59.46 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  40.26 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  40.26 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  40.26 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  44.07 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  44.07 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  44.07 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  40.26 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  54.55 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  54.55 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  61.11 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  54.35 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  36.71 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  57.58 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5509  hypothetical protein  40.58 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  44.83 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  35.53 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  39.53 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  45.61 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  54.29 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  39.47 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  42.22 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  51.35 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  52.94 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  47.37 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  32.1 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  47.37 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  38.16 
 
 		 88 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  48.48 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  36.99 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  34.18 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>