More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38320 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 		 223 aa  433  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  69.41 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0508  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.06 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  37.29 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  40.13 
 
 		 363 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  45.39 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  34.93 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  37.99 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.75 
 
 		 458 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  37.43 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  39.06 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.27 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  34.25 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.58 
 
 		 286 aa  111  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  37.87 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  37.87 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  35.85 
 
 		 268 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  33.79 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  39.18 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  38.85 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  33.69 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  37.97 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  40.11 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  38.5 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.34 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  34.54 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  32.13 
 
 		 247 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  39.26 
 
 		 279 aa  106  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.39 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  35.45 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.96 
 
 		 201 aa  105  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  33.16 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  36.41 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  41.94 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  37.95 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  42.47 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  35.57 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  38.54 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  35.57 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  35.57 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  35.57 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  30.29 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  35.29 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  34.09 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  36.56 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  38.16 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  32.24 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  35.71 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  38.16 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  37.11 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  32.24 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  34.46 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  34.9 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  34.9 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.9 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  34.9 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  34.9 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  34.9 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  38.07 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  31.91 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  32.24 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  35.81 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  41.1 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  35.12 
 
 		 277 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  36.96 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  35.14 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  40.13 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.53 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  39.51 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.81 
 
 		 229 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  31.77 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  37.91 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  33.89 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  34.92 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  32.45 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  35.53 
 
 		 211 aa  98.6  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  32.48 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  33.54 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  39.61 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  35.37 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  33.54 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  35.53 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  33.54 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  39.61 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  39.61 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  31.96 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  38.5 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  36.96 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  39.41 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  31.61 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.37 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  33.51 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1453  hypothetical protein  33.53 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  35.48 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  34.01 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>