More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  74.71 
 
 		 354 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  68 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  68 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  68 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  69.25 
 
 		 350 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  68.84 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  70.17 
 
 		 355 aa  481  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  65.13 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  66.86 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  66.95 
 
 		 357 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  70.4 
 
 		 350 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  71.18 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  67.82 
 
 		 362 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  70.37 
 
 		 361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  69.57 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  69.43 
 
 		 363 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  69.71 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  70 
 
 		 362 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  64.57 
 
 		 357 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  69.62 
 
 		 364 aa  454  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  66.86 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  63.69 
 
 		 367 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  66.96 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  64.2 
 
 		 356 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  67.73 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  61.43 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  66.86 
 
 		 373 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  60.57 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  69.05 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  64.96 
 
 		 366 aa  418  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  58.29 
 
 		 365 aa  413  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  57.93 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  67.34 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  65.78 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  60.85 
 
 		 369 aa  378  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 356 aa  355  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 378 aa  352  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  48.47 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  52.89 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  48.26 
 
 		 353 aa  343  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  48.48 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  48.42 
 
 		 355 aa  342  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  48.98 
 
 		 355 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  48.09 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  51.45 
 
 		 357 aa  341  9e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  52.48 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  46.59 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  46.59 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  52.85 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  52.85 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  52.85 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  51.9 
 
 		 360 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  47.63 
 
 		 358 aa  338  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 358 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.52 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  44.57 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 		 358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 360 aa  336  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 360 aa  335  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 		 356 aa  335  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  47.77 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  47.84 
 
 		 363 aa  332  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  45.56 
 
 		 357 aa  332  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 360 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  44.51 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  47.87 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  47.34 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 355 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>