More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  56.68 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  55.31 
 
 		 274 aa  291  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  55.4 
 
 		 292 aa  285  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  54.71 
 
 		 274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  52.52 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  54.18 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  44.4 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  46.3 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  41.16 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  38.55 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  37.82 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  40.58 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  40.07 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  38.27 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  38.27 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  38.27 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  38.27 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12191  hypothetical protein  38.68 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.69283e-42  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2903  putative F420-dependent oxidoreductase  39.15 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.795057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  34.17 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  33.21 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  35.14 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  36.17 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  39 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  33.45 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  38.5 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  44.87 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  44.87 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  44.87 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  35.38 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  38.66 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  36.78 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  36.08 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  32.96 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  34.36 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  36.4 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  33.71 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  33.71 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  34.76 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.21 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  33.71 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  36.4 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  35.94 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  35.45 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  35.33 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  35.91 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  33.83 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  33.33 
 
 		 324 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  35.75 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  35.75 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  35.75 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  34.18 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.3 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  34.84 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  34.3 
 
 		 306 aa  99  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  34.78 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  34.19 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  32.1 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  35.68 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  31.11 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  33.87 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  32.65 
 
 		 289 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  29.96 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  33.77 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  28.63 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  38.67 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  36.46 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  33.17 
 
 		 285 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  38.36 
 
 		 296 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  35.1 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.45 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.68 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  31.08 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  31.8 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.07 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6389  luciferase family protein  36.17 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  33.17 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4930  luciferase-like protein  40.14 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  34.45 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  31.23 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  35.29 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  32.47 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.07 
 
 		 342 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.44 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  29.17 
 
 		 387 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  33.99 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.98 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 		 374 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  31.75 
 
 		 299 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  33.97 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  38.41 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>