More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_23650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  100 
 
 
250 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0542068 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
254 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
253 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
254 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
247 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
247 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
247 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
254 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  39.47 
 
 
254 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.83 
 
 
254 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
254 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 
254 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
260 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
249 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  38 
 
 
249 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  38 
 
 
249 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
266 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
268 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
271 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
263 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
267 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
260 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
264 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
271 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
255 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.66 
 
 
255 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 
259 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.26 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.26 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
256 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
265 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
287 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2344  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
260 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
273 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
265 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  32.8 
 
 
261 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
265 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
257 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
265 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
263 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
266 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
266 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  33.59 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  30.42 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  33.59 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.1 
 
 
259 aa  113  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
273 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.66 
 
 
663 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 
260 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
266 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>