More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 		 140 aa  282  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  68.5 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  64.75 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.54 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  63.43 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  62.41 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  63.64 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  58.52 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  54.68 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.87 
 
 		 153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  63.57 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  59.7 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  62.12 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  61.19 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  62.2 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.45 
 
 		 159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  53.24 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  57.75 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  62.5 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  57.66 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  58.91 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  60.94 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  60.16 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  58.7 
 
 		 195 aa  157  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  58.7 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  58.7 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  58.91 
 
 		 170 aa  157  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  56.06 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  57.58 
 
 		 201 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  55.97 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.82 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  56.39 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  55.64 
 
 		 173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  58.59 
 
 		 147 aa  149  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  56.59 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  51.08 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  56.59 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  53.54 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  64.08 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  52.55 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  63.83 
 
 		 108 aa  127  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  63.83 
 
 		 108 aa  127  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  47.01 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  47.69 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  47.69 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  31.25 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.35 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.46 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.46 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.46 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.46 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  28.46 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  28.46 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  36.92 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  26.81 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  34.88 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  31.88 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  29.01 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  30.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  30.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  28.57 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  28.91 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  30.37 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  28.57 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  30.43 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  29.63 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  28.57 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 140 aa  67  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>