More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.4 
 
 
251 aa  248  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.77 
 
 
259 aa  214  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.88 
 
 
254 aa  208  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.21 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3457  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.76 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.735617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
269 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
260 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
265 aa  168  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
266 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
273 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 
265 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
274 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
258 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
259 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6323  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
261 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0881362  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
259 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.21 
 
 
260 aa  148  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.98 
 
 
659 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
264 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
254 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.69 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
282 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
263 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
259 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
271 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
271 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
271 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
254 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
257 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
254 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.35 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.35 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
463 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.24 
 
 
263 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
259 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  33.06 
 
 
258 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
260 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  32.65 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
258 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.46 
 
 
262 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
260 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
264 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
266 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5272  short chain enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000022289  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
262 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0774  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730514  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2506  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.74 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>