39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04370 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  100 
 
 		 464 aa  904    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  64.64 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  32.03 
 
 		 515 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  32.3 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  30.56 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  29.53 
 
 		 481 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  30.38 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  32.07 
 
 		 484 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  29.98 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  28.23 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  41.38 
 
 		 489 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13485  integral membrane protein  27.89 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.558357  hitchhiker  0.00735127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  40.68 
 
 		 468 aa  87.4  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  37 
 
 		 467 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  24.25 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  38.37 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  27.91 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  33.33 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  28.38 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  33.93 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  28.37 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  32.76 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  25.9 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  31.9 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  24.53 
 
 		 472 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  24.53 
 
 		 472 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  33.33 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  30.26 
 
 		 485 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  25.08 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0063  hypothetical protein  26.2 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0508702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  32.63 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  24.74 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04090  Protein of unknown function (DUF571)  32.5 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.01663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0321  hypothetical protein  33.06 
 
 		 482 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  25.11 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0073  hypothetical protein  26.2 
 
 		 509 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0082  hypothetical protein  26.2 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201998  decreased coverage  0.00368698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0764  hypothetical protein  24.89 
 
 		 486 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>