27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0475 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  864    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  43.34 
 
 		 473 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  43.4 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  33.19 
 
 		 481 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  31.7 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  34.33 
 
 		 468 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  29.93 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  30.8 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  29.89 
 
 		 472 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  29.89 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  28.02 
 
 		 465 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  29.39 
 
 		 484 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  32.2 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  42.74 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  35.47 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  27.68 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  29.38 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  35.09 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  32.06 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  30.97 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  31.73 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  28.69 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1142  hypothetical protein  34.07 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.873926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1152  hypothetical protein  34.07 
 
 		 437 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269315  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5780  hypothetical protein  26.59 
 
 		 505 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00948256  normal  0.178087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1125  hypothetical protein  34.07 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  25.05 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>