29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4752 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  39.25 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  43.55 
 
 		 462 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  36.08 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  32.9 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  31.5 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  33.61 
 
 		 464 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  32.2 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  30.38 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  31 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  31.84 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  30.04 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  38.66 
 
 		 489 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  47.57 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  33.6 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  43.9 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  26.06 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  38.6 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  37.5 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  34.51 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1125  hypothetical protein  40.37 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1142  hypothetical protein  40.37 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.873926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  35.83 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1152  hypothetical protein  43.48 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269315  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  29.72 
 
 		 646 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  33.33 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  32.98 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5780  hypothetical protein  28.25 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00948256  normal  0.178087 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>