39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1682 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  100 
 
 		 515 aa  999    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  32.18 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  33.59 
 
 		 497 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  32.44 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  27.82 
 
 		 479 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  25.61 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0073  hypothetical protein  27.17 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  27.39 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0063  hypothetical protein  27.29 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0508702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13485  integral membrane protein  28.06 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.558357  hitchhiker  0.00735127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0082  hypothetical protein  26.9 
 
 		 487 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201998  decreased coverage  0.00368698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  25.88 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  25.35 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0764  hypothetical protein  27.02 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  26.65 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  29.72 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  26.64 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  27.45 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  25.64 
 
 		 484 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5780  hypothetical protein  26.24 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00948256  normal  0.178087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  25.3 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  29.63 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  32.14 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  27.15 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  28.18 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  25.2 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  25.2 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  31.76 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0388  hypothetical protein  26.97 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  32.59 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  27.34 
 
 		 489 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0379  hypothetical protein  26.45 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  23.17 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  29.1 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  25.62 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0367  hypothetical protein  26.63 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  27.13 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0321  hypothetical protein  24.86 
 
 		 482 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>