22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3204 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  100 
 
 		 450 aa  828    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  38.92 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  39.8 
 
 		 467 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  26.64 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  31.88 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  33.93 
 
 		 464 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  31.86 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  33.04 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  35.07 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  31.18 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  33.54 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  32.41 
 
 		 465 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  33.64 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  25.66 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  29.1 
 
 		 515 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  29.84 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  27.66 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  31.78 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  26.17 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  27.66 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04090  Protein of unknown function (DUF571)  32.81 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.01663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  39.81 
 
 		 646 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>