22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0307 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  100 
 
 
451 aa  824    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  54.1 
 
 
450 aa  123  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  38.86 
 
 
467 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  28.15 
 
 
473 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  26.42 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  31.52 
 
 
464 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  36.13 
 
 
492 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  26.02 
 
 
472 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  36 
 
 
444 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  34.56 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13485  integral membrane protein  32.82 
 
 
467 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.558357  hitchhiker  0.00735127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  31.93 
 
 
464 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  31.44 
 
 
489 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  29.7 
 
 
462 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  32.43 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  30.56 
 
 
468 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  32.5 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  30.3 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  32.11 
 
 
472 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  27.13 
 
 
515 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  28.24 
 
 
472 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  25.79 
 
 
470 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>