23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4838 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  911    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  30.04 
 
 		 472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  34.68 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  29.75 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  26.23 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  45.08 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  24.21 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  39.34 
 
 		 489 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  42.75 
 
 		 481 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  33.86 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  34.59 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  35.35 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  34.71 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  35.09 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  32.72 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  26.84 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  25.74 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  36.84 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  31.03 
 
 		 441 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  22.8 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  32.5 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  30.58 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04090  Protein of unknown function (DUF571)  30.17 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.01663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>