16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4617 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  100 
 
 		 441 aa  826    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  24.73 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  34.56 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  35.14 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  31.03 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13485  integral membrane protein  41.67 
 
 		 467 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.558357  hitchhiker  0.00735127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  30.63 
 
 		 468 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  31.48 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2490  protein of unknown function DUF571  34.62 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.997634  normal  0.350749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  28.68 
 
 		 473 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  33.63 
 
 		 497 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  31.03 
 
 		 468 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  31.71 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  27.27 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  28.46 
 
 		 462 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>