31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5431 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  100 
 
 		 444 aa  855    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  24.8 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  32.76 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  34.51 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  36.61 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  36.07 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  32.76 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  32.41 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  33.64 
 
 		 468 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  36 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  27.83 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  27.86 
 
 		 489 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  30.53 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  33.59 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  27.46 
 
 		 470 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  33.33 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  31.86 
 
 		 498 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  34.26 
 
 		 497 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1142  hypothetical protein  41.77 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.873926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1125  hypothetical protein  41.77 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0379  hypothetical protein  30.48 
 
 		 459 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0388  hypothetical protein  30.48 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4960  hypothetical protein  31.18 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1152  hypothetical protein  41.77 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269315  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13485  integral membrane protein  37.8 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.558357  hitchhiker  0.00735127 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0321  hypothetical protein  31.36 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  28.71 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0367  hypothetical protein  30.69 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  36.36 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  36.36 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>