31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1209 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  100 
 
 		 472 aa  909    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  35.29 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  34.2 
 
 		 481 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  34.64 
 
 		 472 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  36.96 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  28.94 
 
 		 465 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  29.83 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  29.3 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  27.35 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  29.2 
 
 		 464 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  30.11 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  38.27 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  26.47 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  39.2 
 
 		 489 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  28.54 
 
 		 484 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  38.66 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  27.83 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0388  hypothetical protein  29.55 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0379  hypothetical protein  29.55 
 
 		 459 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  27.45 
 
 		 503 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  25.1 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  27.72 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  25.1 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  28.7 
 
 		 498 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  28.57 
 
 		 497 aa  47  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  25 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  24.38 
 
 		 528 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0367  hypothetical protein  28.35 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  30.47 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0321  hypothetical protein  30.23 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  54.05 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>