20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0388 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0379  hypothetical protein  99.78 
 
 
459 aa  859    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0367  hypothetical protein  99.55 
 
 
444 aa  829    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0388  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  870    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  68 
 
 
485 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0321  hypothetical protein  65.61 
 
 
482 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50668  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  59.96 
 
 
472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  39.96 
 
 
472 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  39.96 
 
 
472 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  35 
 
 
481 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  23.19 
 
 
515 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  29.52 
 
 
472 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  26.46 
 
 
473 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  27 
 
 
508 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0063  hypothetical protein  27.09 
 
 
487 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0508702 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  30.48 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0082  hypothetical protein  27.09 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201998  decreased coverage  0.00368698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0073  hypothetical protein  27.09 
 
 
509 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0764  hypothetical protein  26.18 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  26.7 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13922  transmembrane protein  25.18 
 
 
509 aa  43.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>