25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8521 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  100 
 
 		 489 aa  911    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  35.88 
 
 		 468 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  33.75 
 
 		 481 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  32.32 
 
 		 472 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  31.52 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  31.64 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  29.46 
 
 		 465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  29.98 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  39.68 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  40.1 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  38.66 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  33.4 
 
 		 472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  43.55 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  30.04 
 
 		 484 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  39.34 
 
 		 468 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  34.62 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  41.32 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  25.88 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  27.78 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  30.84 
 
 		 451 aa  53.5  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  27.42 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  29.29 
 
 		 492 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  24.44 
 
 		 508 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  40.62 
 
 		 646 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  30.97 
 
 		 497 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>