27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7883 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  100 
 
 		 646 aa  1258    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  47.71 
 
 		 481 aa  87.4  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  37.79 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  40.52 
 
 		 468 aa  72  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  37.07 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  30.91 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  31.28 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  40 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  37.82 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  40.71 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  34.25 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  36.44 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  38.24 
 
 		 498 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  36.43 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  36.51 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  33.6 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  36.11 
 
 		 484 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  32.59 
 
 		 472 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  35.9 
 
 		 492 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  31.66 
 
 		 465 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  36.45 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  35.2 
 
 		 497 aa  49.7  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1142  hypothetical protein  38.33 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.873926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04090  Protein of unknown function (DUF571)  31.9 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.01663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  39.29 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1125  hypothetical protein  38.33 
 
 		 443 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1152  hypothetical protein  38.1 
 
 		 437 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269315  normal  0.448539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>